Globaalien muuttujien käyttöön liittyy ohjelmoijan kannalta yleisiä hallintavaikeuksia.
Suuresta ohjelmasta on hankala suoraan nähdä, missä kaikkialla globaalia muuttujaa käytetään.
Globaalin muuttuja käyttöön liittyvän virheen paikallistaminen voi siten olla hankalaa.